Préparation des échantillons biologiques pour les analyses protéomiques

Description / Workflow

Prise en charge des étapes pré-analytiques de biochimie (séparation et digestion des protéines, enrichissement et pré-fractionnement peptidiques par exemple) pour les études protéomiques.

Applications

• Fractionnement des mélanges protéiques complexes par électrophorèse
• Digestion enzymatique en gel ou liquide des protéines
• Enrichissement protéique (déplétion des protéines majoritaires) ou peptidique (phosphopeptides)

Pré-requis / Contraintes

La préparation des échantillons requiert un environnement « propre » et du matériel spécifique à l’analyse protéomique afin de limiter au maximum les sources potentielles de contamination (kératines, polymères, etc.).

Une quantité suffisante en protéines dans l’échantillon est nécessaire.

Chaque site dispose d’un laboratoire de biochimie dédié à la préparation de ce type d’échantillon (systèmes d’électrophorèse, hottes à flux laminaires, scanner, speed-vac etc.).

Certains équipements sont mis à la disposition des collaborateurs souhaitant préparer leurs échantillons (sous condition de formation par le personnel du plateau) : se renseigner.

Technologies

• SDS Page 1D
• Digestion
• Fractionnement
• Enrichissement
• Déplétion
• Dessalage
• Marquage chimique (TMT/iTRAQ)

Plateaux