Pôle Protéome de Montpellier

Pôle Protéome de Montpellier

Découvrez en détail notre plateforme et nos différents plateaux

PPM : Présentation

Le Pôle Protéome de Montpellier (PPM) est l’une des plateformes en sciences du vivant de l’Unité d’Appui à la Recherche BioCampus Montpellier et regroupe les capacités technologiques de l’analyse protéomique sur Montpellier et ses environs.

Expertises dans différents domaines de la protéomique

Nous mettons en œuvre tout type d’approche protéomique à haut et moyen débit et notre expertise couvre la plupart des technologies actuelles utilisées en protéomique :

  • Préparation des échantillons biologiques (purification, séparation et préfractionnement) pour les analyses protéomiques
  • Analyses protéomiques quantitatives à large échelle (avec ou sans marquage)
  • Analyses protéomiques quantitatives ciblées, en particulier pour la validation de biomarqueurs
  • Etude des modifications post-traductionnelles telles que les phosphorylations, ubiquitinations
  • Etude des interactions protéine-protéine et protéine-ligand, notamment par des approches AP-MS
  • Analyses bioinformatiques et biostatistiques des données avec des outils de référence internationale

Qualité

La plateforme PPM, certifiée ISO 9001:2015 depuis 2015, garantit des analyses protéomiques fiables, traçables et conformes aux standards internationaux, tout en assurant confidentialité et valorisation des résultats.

Membre de l’infrastructure nationale ProFI et labellisée IBiSA

PPM : Site FPP (IGF)

La Plateforme de Protéomique Fonctionnelle (FPP), spécialisée dans la spectrométrie de masse à haute résolution, propose une expertise et des technologies de pointe dédiées à l’identification et la quantification de protéines, à l’analyse différentielle (avec ou sans marquage) ou encore à la recherche de partenaires protéiques. La plateforme est également équipée d’un spectromètre de masse dédié à la protéomique structurale afin de permettre l’étude des interactions protéines-protéines et ligands-protéines ainsi que leur dynamique structurale dans des conditions natives.

Expertise et services

Équipe & Équipements

Rôle Nom Téléphone Localisation
Responsables scientifiques Martial Séveno 92 17 IGF Sud, RDC 29
Séverine Chaumont-Dubel 92 17 IGF Sud, RDC 29
Responsable technique Serge Urbach Analyse par spectrométrie de masse 92 17 IGF Sud, RDC 29
Activité de protéomique « bottom-up » Mathilde Decourcelle Analyse par spectrométrie de masse 92 17 IGF Sud, RDC 29
Khadija El Koulali Préparation biochimique des échantillons 92 17 IGF Sud, RDC 29
Activités de protéomique structurale Cherine Bechara Analyse par spectrométrie de masse 93 45 IGF Sud, RDC 25
Tristan Girbau (CDD) Analyse par spectrométrie de masse 93 45 IGF Nord, RDC 207c
Système d’information Oana Vigy Ingénierie logicielle 92 17 IGF Sud, RDC 29

*Faire précéder les numéros de poste par 04 34 35 (** **)
**Institut de Génomique Fonctionnelle

Tarifs

Un devis sera fourni sur demande pour toute demande de prestation.

Un devis sera fourni sur demande pour toute demande de prestation.

1 – Équipes locales relevant d’une structure rattachée à l’une des trois tutelles de BioCampus (UM, INSERM et CNRS) ou équipes INSERM nationales.
2 – Les autres partenaires académiques du site et hors site.

Prestations Tarifs en euros (HT) Inclus
Équipe du site1 Équipe académique hors site2 Privé
Précipitations 4,01 5,00 10,00
  • Précipitations (TCA/Acétone)
Gel 29,84 37,18 74,36
  • Gel/Dépôt
  • Migration
  • Fixations/Coloration/Lavages
Digestion in Gel 24,64 30,70 61,41
  • Découpe et lavages
  • Réduction/Alkylation
  • Digestion (trypsine ou autre enzyme)
  • Extraction
Digestion in Gel (autre enzyme) 100,93 125,76 251,51
Digestion S-TRAP 17,14 21,35 42,71
  • Colonne S-TRAP (mini ou micro)
  • Réduction/Alkylation
  • Digestion (trypsine)
  • Lavages
  • Elution
Digestion liquide ≤ 10μg 4,41 5,50 11,00
  • Réduction/Alkylation
  • Digestion
  • Dessalage
Digestion liquide ≥ 10μg 8,34 10,40 20,79
Double digestion liquide ≤ 10μg 15,84 19,73 39,46
  • Réduction/Alkylation
  • Digestion
  • Dessalage
Double digestion liquide ≥ 10μg 19,76 24,63 49,25
TMT2 150,75 187,84 375,69
  • Marquage 2 échantillons
TMT6 535,97 667,81 1335,63
  • Marquage 6 échantillons
TMT10 1184,24 1475,57 2951,14
  • Marquage 10 échantillons
TMT16 1578,66 1967,01 3934,01
  • Marquage 16 échantillons
Enrichissement phospho 38,74 48,27 96,54
  • Enrichissement (FeNTA et Ti02)
Fractionnement 32,00 39,87 79,74
  • Fractionnement (High pH Reversed-Phase) en 8
Dessalage 5,70 7,11 14,22
  • Dessalage (zip tip, OMIX)
LCMSMS 100,24 111,10 333,30
  • Heure d’acquisition sur système LCMSMS haute résolution
Expertise Biochimie 20,09 20,10 60,30
  • Heure de préparation biochimique d’échantillons protéiques et/ou peptidiques en vue d’une analyse protéomique
Analyse 40,16 40,19 120,56
  • Heure de (re)traitement bioinformatique

Un devis sera fourni sur demande pour toute demande de prestation.

1- Équipes relevant d’une structure rattachée à l’une des trois tutelles de BioCampus (UM, INSERM et CNRS).
2- Les autres partenaires académiques du site, inclus dans le périmètre de MUSE, et les autres académiques hors site.

Prestations Tarifs en euros (HT) Inclus
Équipe du site1 Équipe académique hors site2 Privé
Natif 1254,02 1441,25 1500
  • Dessalage et échange de tampon
  • Analyse (1/2 journée) par spectrométrie de masse (MS)
Analyse natif 85,92 104,80 200
  • 2 heures de (re)traitement bioinformatique
HDX 4024,50 4627,44 8000
  • Echange hydrogène-deutérieum
  • Digestion
  • Analyse HPLC-MS (1 jour)
Analyse HDX 569,41 653,93 1600
  • Retraitement des résultats de HDX-MS

Contact site FPP

Responsables scientifiques :
Martial Séveno et Séverine Chaumont-Dubel

Responsable technique :
Serge Urbach

Vous pouvez nous contacter via notre formulaire de contact (en selectionnant le site FPP).

PPM : Site MSPP (IPSiM)

La Plateforme de Spectrométrie de Masse Protéomique (MSPP) est spécialisée dans la caractérisation d’événements post-traductionnels et de mécanismes de signalisation impliqués dans la réponse des plantes à divers stress, notamment les variations quantitatives de phosphorylation des protéines membranaires.

Expertise et services

Équipements

Tarifs

Un devis sera fourni sur demande pour toute demande de prestation.

Contact site MSPP

Responsable scientifique :
Christian Dubos

Responsable technique :
Valérie Rofidal

Vous pouvez nous contacter via notre formulaire de contact (en selectionnant le site MSPP).

PPM : Site PPC (IRMB)

La Plateforme de Protéomique Clinique (PPC) a pour objectif de rendre disponible une expertise médicale, biologique et technique en protéomique clinique. La plateforme vise à exploiter les derniers développements technologiques en spectrométrie de masse et en immuno dosage pour la découverte, la validation et l’utilisation de biomarqueurs dans de nombreuses pathologies humaines.

Expertise et services

Équipements

Tarifs

Un devis sera fourni sur demande pour toute demande de prestation.

Contact site PPC

Responsable scientifique :
Christophe Hirtz

Responsable technique :
Jérôme Vialaret

Vous pouvez nous contacter via notre formulaire de contact (en selectionnant le site PPC).

PPM : Organigramme

Direction de la plateforme PPM

    Responsable Scientifique :

  • Martial SEVENO
    • (IR, CNRS, 40%)

    Responsable opérationnel :

  • Jerome VIALARET
    • (IE, CHU, 20%)
+-

Comité de Direction

  • Severine CHAUMONT-DUBEL
  • Christian DUBOS
  • Christophe HIRTZ
  • Alain MANGE
  • Valérie ROFIDAL
  • Martial SEVENO
  • Serge URBACH
  • Jerome VIALARET
+-

Comité d'orientation scientifique et technique

    Experts externes :

  • Ludovic BONHOMME
    • (GDEC, Clermont-Ferrand)
  • Pascale COSETTE
    • (Pissaro, Rouen)
  • Chiara GUERRERA
    • (PPN, Paris)
  • Christine SCHAEFFER
    • (LSMBO, Strasbourg)

    Experts locaux :

  • Jérôme DEJARDIN
    • (IGH, Montpellier)
  • Dominique HELMLINGER
    • (CRBM, Montpellier)
  • Hamza MAMERI
    • (IATE, Montpellier)
  • Jérôme MOREAUX
    • (IGH, Montpellier)
  • Bruno ROBERT
    • (IRCM, Montpellier)
+-

Correspondant

  • Responsable Management Qualité : Mathilde DECOURCELLE
  • Communication : Khadija EL KOULALI
  • Developpement durable : Khadija EL KOULALI
  • Communication : Oana VIGY
  • Informatique : Oana VIGY
+-

Protéomique fonctionnelle FPP - IGF

    Responsable Scientifique :

  • Severine CHAUMONT-DUBEL
    • (MC, UM, 15%)
  • Martial SEVENO
    • (IR, CNRS, 60%)

    Responsable Technique :

  • Serge URBACH
    • (IR, CNRS, 100%)

    Personnel plateau permanent :

  • Cherine BECHARA
    • (PU, UM, 10%)
  • Mathilde DECOURCELLE
    • (IE, CNRS, 80%)
  • Khadija EL KOULALI
    • (AI, CNRS, 100%)
  • Alain MANGE
    • (IR, UM, 30%)
  • Oana VIGY
    • (IE, CNRS, 90%)

    Personnel plateau CDD :

  • Tristan GIRBAU
    • (CDD IE, CNRS, 100%)
  • Florine LEIPP
    • (CDD IE, UM, 100%)
+-

Spectrométrie de masse protéomique MSPP - IPSiM

    Responsable Scientifique :

  • Christian DUBOS
    • (DR, INRAe, 20%)

    Responsable Technique :

  • Valérie ROFIDAL
    • (AI, INRAe, 100%)

    Personnel plateau permanent :

  • Nathalie BERGER
    • (IE, INRAe, 10%)
  • Vincent DEMOLOMBE
    • (T, INRAe, 100%)
  • Marc TAUZIN
    • (T, INRAe, 50%)
+-

Protéomique clinique PPC

    Responsable Scientifique :

  • Christophe HIRTZ
    • (PU, UM, 20%)

    Responsable Technique :

  • Jerome VIALARET
    • (IE, CHU, 80%)

    Personnel plateau permanent :

  • Alexandre DAVID
    • (DR, INSERM, 10%)
  • Constance DELABY
    • (MC, UM, 10%)

    Personnel plateau CDD :

  • Aurore ATTINA
    • (CDD IE, CHU, 100%)
  • Salomé COPPENS
    • (CDD IE, UM, 20%)
  • Maïssam EZZIANI
    • (CDD T, CHU, 100%)
  • Laura FICHTER
    • (CDD Thèse, UM, 20%)
  • Jana KINDERMANS
    • (CDD T, CHU, 100%)
  • Nicolas PRADEILLES
    • (CDD T, CHU, 100%)
+-