Au niveau national, le PPM participe activement et depuis de nombreuses années aux réflexions sur l’avenir de la discipline en France en lien avec l’Infrastructure Nationale en Biologie et Santé ProFi (Proteomics French Infrastructure).

En octobre 2022, un réseau des plateformes associées ProFi-PA a été créé et le PPM l’a intégré dès sa création.

Ce réseau fédère des actions au sein de la communauté protéomique française et co-construit une stratégie pour la communauté protéomique via une charte.